Dans la ville d'Oxford de notre monde, le jeune Will est à la recherche de son père, explorateur disparu en Alaska. En fuite après avoir tué un homme lors du cambriolage de leur maison, il découvre une brèche menant à un carrefour entre les mondes parallèles, la cité de Cittagazze, habitée par des enfants perdus et des spectres mangeurs d’âmes. Il y rencontre alors Lyra et Pantalaimon, passés au-delà de l’Aurore du Grand Nord, par le pont que Lord Asriel, son père, a ouvert entre les différents univers. Tout en haut d’une étrange tour, Will se bat contre un inconnu et devient le Porteur du Poignard Subtil, arme mystérieuse forgée pour couper n’importe quelle matière et ouvrir des brèches dans la structure de l’univers, permettant de créer et contrôler à volonté des fenêtres sur d’autres mondes. Mme Coulter est toujours à la recherche de Lyra, tandis que Lord Asriel réunit une armée pour détruire une fois pour toute l’Autorité et le Magisterium. Les deux enfants recevront l’aide du Docteur Mary Malone, des sorcières, de l’aéronaute texan Lee Scoresby qui retrouvera le père de Will, John Parry, devenu chaman et venu confier une ultime mission au Porteur du Poignard Subtil, objet crucial dans la guerre qui s’annonce entre Asriel et les forces du Magisterium. La qualité littéraire et le style sont toujours là, l’histoire se complexifie et devient plus adulte à mesure que l’aventure se poursuit.